Biblioteka Gdańskiego Klubu Fantastyki jest jedną z największych bibliotek fantastyki w Polsce. Zawiera ona obecnie blisko siedem tysięcy pozycji. Znaleźć w niej można praktycznie wszystkie publikacje wydane od początku lat 90-tych i zdecydowaną większość wcześniejszych (w tym kilka z dwudziestolecia międzywojennego). Zasady pracy biblioteki opisane są szczegółowo w "Regulaminie Działu Bibliotecznego".

Nabywanie nowych pozycji to jedno z kluczowych zadań statutowych GKF. Biblioteka zaopatrywana jest w nowości na bieżąco, dzięki pracy Działu Kolportażu. Jeżeli jakaś książka pojawia się na rynku – zwykle po 2-3 tygodniach ma już swoje miejsce na naszych półkach.

Biblioteka GKF składa się z czterech sekcji:
Sekcji Polskojęzycznej (aktualnie ok. 5000 pozycji)
Sekcji Anglojęzycznej (900 pozycji)
Sekcji Komiksów (800 pozycji)
Sekcji Fanzinów i Czasopism (1400 pozycji).
W Sekcji Polskojęzycznej, prócz beletrystyki, znajduje się wiele albumów oraz wydawnictw non-fiction (krytyczne, popularnonaukowe, naukowe – oczywiście powiązane w jakiś sposób z fantastyką lub bliskimi jej dziedzinami).

Biblioteka GKF mieści się w siedzibie GKF. Udostępniana jest członkom Klubów Lokalnych GKF w każdą środę, w godzinach 17:00-19:00. Ze względów organizacyjnych jednorazowo można wypożyczać do 3 pozycji. Szef Działu może podwoić limit wypożyczanych książek członkom, którzy w ciągu ostatniego roku terminowo rozliczali się z biblioteką. Zalecane jest oddawanie książek w czasie miesiąca od wypożyczenia. Limitem ostatecznym jest 45 dni kalendarzowych. Przekroczenie powyższego czasu wiąże się z koniecznością wpłacenia opłaty karnej przy zwrocie (1 zł od książki, za każdy zaczęty miesiąc powyżej limitu ). Do momentu uregulowania należności, osoba przetrzymująca traci prawo do korzystania z biblioteki.